Estudio mediante técnicas moleculares del tanatomicrobioma intestinal en la estimación del intervalo post mortem temprano empleando un modelo de ratón / Early post mortem interval estimation in a mouse model using molecular analyses of the gut thanatomicrobiome

Introducción: en la actualidad, la falta de métodos cuantitativos fiables ha llevado a distintas líneas de investigación a buscar un modelo que prediga el intervalo post mortem (IPM). El tanatomicrobioma, presente desde el momento de la muerte, parece sufrir cambios predecibles y que siguen una correlación con el IPM.Materiales y métodosse ha analizado experimentalmente el comportamiento del tanatomicrobioma en la región del intestino delgado posterior y del colon ascendente durante las primeras 24 h de descomposición en Mus musculus. Para ello, se ha llevado a cabo una aproximación molecular basada en el análisis del gen ribosomal 16S (ARNr 16S) mediante electroforesis en gel con gradiente desnaturalizante (DGGE) y, seguidamente un análisis de la alfa y beta diversidad.Resultadoslos resultados basados en el análisis de los índices de diversidad ecológica reflejaron cambios estadísticamente significativos antes de las 12 h, y un descenso de la diversidad a partir de esas 12 h postmortem, siendo este estadísticamente significativo en las 2 regiones intestinales analizadas. Por otro lado, el estudio comparativo de las comunidades microbianas mostró que cambian estructurada y diferenciablemente desde el momento de la muerte, alejándose en similitud de las mostradas en vida (IPM 0 h).Discusiónestos resultados coinciden con el descenso de la diversidad sugerido a largo plazo por distintos autores. Sin embargo, en las condiciones del estudio, se ha visto que este descenso no se inicia hasta las 12 h. Conclusión como conclusión, se han podido establecer, según los cambios en la diversidad bacteriana, fases de la dinámica bacteriana durante la descomposición que podrían ayudar a mejorar los modelos de correlación microbiana para la estimación del IPM. (AU)

Introduction: Currently, the lack of reliable quantitative methods has led different research lines to find a model that predicts the postmortem interval (PMI). The thanatomicrobiome, present from the moment of death, has been shown to change in predictable ways, allowing a correlation with PMI.Materials and methodsIn this study, the shifts of the thanatomicrobiome in the region of the posterior small intestine and the ascending colon in Mus musculus during the first 24 hrs of decomposition have been analyzed experimentally. For this purpose, a molecular approach based on the analysis of the 16S ribosomal gene (16S rRNA) and a denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) was adopted, followed by analyses of the ecological diversity indices Alpha and beta diversity.ResultsThe results based on the analysis of the ecological diversity indices reflected statistically significant changes before 12 hrs, and a decrease in diversity after 12 hrs postmortem, this being statistically significant in the two intestinal regions analyzed. Moreover, the comparative study of microbial communities indicated distinct and structured changes from the moment of death, with shifts in the degree of similarity from the composition detected in life (PMI 0 hrs).DiscussionThese results agree with other studies demonstrating a decrease in microbial diversity. However, under the conditions of the study, this decrease does not begin until 12 hrs after death. Conclusions: In conclusion, by examining the dynamics of bacterial diversity our study has identified phases during decomposition that could help to improve microbial correlation models for PMI estimation. (AU)

Revisión sobre las nuevas perspectivas de datación cadavérica desde el necrobioma / Review of cadaveric dating methods and new perspectives from the necrobiome

Hoy en día existen numerosas estrategias desde un punto de vista científico que ayudan a esclarecer los casos forenses, entre ellas la datación cadavérica. La ausencia de métodos fiables cuantitativos para estimar el intervalo post mortem explica el incremento de nuevas líneas de investigación prometedoras con dicha finalidad. Tras la aparición de las nuevas técnicas de secuenciación masiva y bioinformáticas, surge también el estudio del necrobioma como un área novedosa y poco estudiada dentro de las ciencias forenses, que se ha llegado a denominar «microbiología forense». En esta revisión se realiza un breve recorrido por las técnicas y procedimientos existentes de datación cadavérica, centrándose en la utilidad del tanatomicrobioma, o conjunto de microorganismos presentes en el momento de la muerte, que podría ser un método prometedor para la estimación del intervalo post mortem en el futuro. (AU)

Nowadays there are numerous scientific strategies that helping to clarify forensic cases, including time since death. The absence of reliable quantitative methods to estimate the post-mortem interval explains the increase in promising new lines of research for this purpose. After the appearance of the new techniques of massive sequencing and bioinformatics, also arises the study of the necrobiome through a new and little studied area within the forensic sciences, Forensic Microbiology. In this review, a tour of the existing techniques and procedures of cadaveric dating is made, which includes new cutting-edge techniques in different areas of knowledge and also mentions the utilities of Forensic Microbiology, where the thanatomicrobiome, present from the moment of death, according to recent studies, points to be a promising method for estimating the post-mortem interval in the future. (AU)

[Post-mortem microbiology analysis]. / Análisis microbiológico post mórtem.

Post-mortem microbiology is useful in both clinical and forensic autopsies, and allows a suspected infection to be confirmed. Indeed, it is routinely applied to donor studies in the clinical setting, as well as in sudden and unexpected death in the forensic field. Implementation of specific sampling techniques in autopsy can minimize the possibility of contamination, making interpretation of the results easier. Specific interpretation criteria for post-mortem cultures, the use of molecular diagnosis, and its fusion with molecular biology and histopathology have led to post-mortem microbiology playing a major role in autopsy. Multidisciplinary work involving microbiologists, pathologists, and forensic physicians will help to improve the achievements of post-mortem microbiology, prevent infectious diseases, and contribute to a healthier population.